X射线放疗一般需要达到60-80Gy左右的总剂量，按照2Gy/天的分割剂量，治疗过程会持续一个月左右。好在每次照射只需要几分钟，比如射波刀每分钟可以输出8Gy的剂量，刚躺下治疗就结束了。而质子、重离子治疗一般需要达到100-200Gy左右的总剂量，每次照射十五分钟，分数次到数十次完成治疗，持续治疗一个月左右。
而相比之下，BNCT放疗有着更明显的优势，那就是把照射时间控制在一个小时内。只是在治疗过程当中，患者在接受照射的一个小时内需要保持同一个姿势，完全不能动弹，这对患者的身体有着较大的负担。
好在有了“强流质子加速器”这一“黑科技”，BNCT照射时间长的问题基本可以完全解决。目前的低能强流质子加速器束流可到数十毫安(10-50mA)，每毫安质子可以产生10^12-10^13中子/秒，加速器中子源的总中子产额在10^13-10^14中子/秒，在人体产生的等效剂量率可达几个Gy-Eq/分钟，那么单次照射时间也将大幅度减少了。
而低能强流质子加速器也有很广泛的用途，每一个高能质子加速器背后都有一个或几个低能强流质子加速器。比如，意大利的核能研究机构就想从用于核能研究(意大利ADS可行性研究项目)的高能质子加速器的低能段引出5兆电子伏特的质子，用来产生BNCT放疗用的中子。
在“黑科技”的加持下，治疗照射时间大幅度缩短，再加上疗法只需治疗一次的优势，从而让BNCT的治疗过程更高效，且为患者免去多次进行治疗的麻烦，提高了治疗的整体效率。
